A reação do cloro, com materiais orgânicos na água, dá origem a resíduos orgânicos, que contêm cloretos, como o cloroformio, tetracloreto de carbono, clorometano e outros, geralmente conhecidos como trialometanos(THMs). Os THMs, estão identificados como sendo cancerígenos, estando implicados no desenvolvimento de câncer de colón e outros.

Daí a importância de não consumir água tratada com cloro.
O ozônio, ao destruir as bactérias e vírus presentes na água, não forma os trialometanos.

No passado, a postura usual da Saúde Pública era " aonde há duas ou mais pessoas bebendo da mesma fonte, esta tem que ser clorada". Finalmente, esta atitude está mudando graças a uma conscientização maior sobre os riscos à saúde associados ao uso do cloro para desinfetar a água. Enquanto que a água deve estar livre de patógenos causadores de enfermidades, também deve ficar livre dos subprodutos da desinfeção, que causam também enfermidades. O cloro vem servindo às comunidades durante quase um século. E assim também tem feito o Ozônio. Há 90 anos era demasiado caro o equipamento para a sua produção e não eram muito confiáveis, enquanto que o cloro era barato e seus efeitos secundários desconhecidos. Por causa do mal sabor do cloro e de sua má reputação como gás tóxico durante a 1ª Guerra Mundial, o Ozono já se havia visto favorecido por muitos países Europeus. Hoje a tecnologia da eletrónica em estado sólido fez com que os geradores de Ozono sejam relativamente econômicos e seguros. Já que o cloro tem estado circulando durante tanto tempo, muitos inspetores de saúde não pensam mais que este seja um gás tóxico. O uso do cloro para desinfetar os abastecimentos de água potável diminuiu verdadeiramente a incidência de grandes brotes de tifo, cólera e desinteria - porém muitas enfermidades de longa duração foram substituídas por estes velozes assassinos: os THMs. Ainda não se dispõe de uma informação completa, porém em muitos estudos se chegou à conclusão de que enfermidades do coração, câncer e asma estão diretamente vinculadas a derivados dos desinfetantes, como os Trihalometatos (THMs) e os ácidos Halo-acéticos. Já que há milhares de possíveis moléculas orgânicas presentes na água, também há milhares de cloro-orgânicos, formados quando estos organismos reagem com o cloro. Cada um dos quais testados até agora mostram efeitos cancerígenos.

A escolha definitiva é o Ozônio.